Auteur de deux coups d'Etat en moins d’un an, dont le premier a renversé le défunt président Ibrahim Boubacar Keïta le 18 août 2020, affaibli par la contestation menée depuis des mois par le M5-RFP (Mouvement du 5 juin-Rassemblement des forces patriotiques), et le second contre le premier dirigeant de la transition, Bah N'Daw.
Investi le 7 juin 2021 en tant que le président de la transition, Assimi Goïta et son équipe se sont intéressés tout d’abord à la situation sécuritaire au Mali en essayant de lutter contre le djihadisme. Une priorité, selon eux, avant l’organisation des élections générales.
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Cette démarche a été vivement saluée par de nombreux Maliens, même si pour d’autres, sur le plan sécuritaire, il y a eu plutôt des acquisitions d’équipements militaires, mais pas d’avancée sur le terrain. Aussi, les Maliens ont fondé beaucoup d’espoir sur la relecture de l’Accord pour la paix et la réconciliation, laquelle se fait toujours attendre.