Un train de marchandises et un train de passagers sont entrés en collision, selon un communiqué du ministère.
Trente ambulances ont immédiatement été dépêchées à Kom Hamada, la localité où s'est produit l'accident, a indiqué le porte-parole du ministère Khaled Megahed.
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Les morts et les blessés ont été transportés vers des hôpitaux, a-t-il ajouté.
Cet accident intervient quelques mois après qu'une collision entre deux trains près d'Alexandrie a fait 41 morts, en août 2017.